Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC85BQ15834 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms