Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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