Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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NCOA1Q15788 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA1Q15788 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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