Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TRIP10Q15642 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TRIP10Q15642 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TRIP10Q15642 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TRIP10Q15642 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TRIP10Q15642 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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TRIP10Q15642 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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TRIP10Q15642 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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TRIP10Q15642 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms