Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRADDQ15628 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
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