Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms