Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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GBX1Q14549 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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GBX1Q14549 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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GBX1Q14549 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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