Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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TUBA3CQ13748 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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TUBA3CQ13748 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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TUBA3CQ13748 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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TUBA3CQ13748 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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TUBA3CQ13748 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TUBA3CQ13748 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TUBA3CQ13748 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TUBA3CQ13748 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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