Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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