Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms