Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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