Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE3BQ13370 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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