Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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