Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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PTPRJQ12913 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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