Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
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