Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms