Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDE4DQ08499 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms