Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms