Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms