Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSME1Q06323 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME1Q06323 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms