Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms