Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms