Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RELQ04864 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RELQ04864 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms