Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms