Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBSQ01459 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBSQ01459 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms