Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms