Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDM2Q00987 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDM2Q00987 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDM2Q00987 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MDM2Q00987 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms