Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP1S1P61966 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms