Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UFM1P61960 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms