Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VBP1P61758 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VBP1P61758 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VBP1P61758 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VBP1P61758 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VBP1P61758 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VBP1P61758 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VBP1P61758 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms