Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTBP60709 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTBP60709 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ACTBP60709 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ACTBP60709 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ACTBP60709 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ACTBP60709 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ACTBP60709 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTBP60709 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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