Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms