Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCDC1P59894 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCDC1P59894 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms