Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GJA9P57773 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GJA9P57773 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJA9P57773 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJA9P57773 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms