Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLDN15P56746 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLDN15P56746 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN15P56746 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN15P56746 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN15P56746 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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