Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NME5P56597 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NME5P56597 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NME5P56597 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NME5P56597 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME5P56597 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms