Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPTEP56180 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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