Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP9P55211 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms