Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23BP54727 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms