Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX2P50458 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LHX2P50458 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX2P50458 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX2P50458 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX2P50458 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX2P50458 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX2P50458 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX2P50458 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX2P50458 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LHX2P50458 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LHX2P50458 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LHX2P50458 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LHX2P50458 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LHX2P50458 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LHX2P50458 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LHX2P50458 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LHX2P50458 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LHX2P50458 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LHX2P50458 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LHX2P50458 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LHX2P50458 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX2P50458 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX2P50458 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms