Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP4P49662 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP4P49662 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms