Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRP9P49458 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP9P49458 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP9P49458 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP9P49458 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP9P49458 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP9P49458 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP9P49458 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP9P49458 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP9P49458 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms