Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT3P49368 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT3P49368 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT3P49368 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms