Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNBP48739 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PITPNBP48739 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms