Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms