Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD52P43351 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD52P43351 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD52P43351 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms