Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NSG1P42857 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSG1P42857 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSG1P42857 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms