Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms