Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGDSP41222 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms