Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms